年5月7日，Naturegenetics在线发表了亚洲棉的基因组文章“ResequencingofdiploidcottonaccessionsbasedonanupdatedAgenomeidentifiesthegeneticbasisofkeyagronomictraits”其中利用了HiC技术用于亚洲棉基因组的提升。
年4月30日，Naturegenetics在线发表了Rose基因组文章“TheRosagenomeprovidesnewinsightsintothedomesticationofmodernroses”，在文章Fig.1中展示了Rose染色体水平的拼接与HiC互作图谱的关联性，通过与HiC互作图谱的强关联性说明拼接的可靠性。由此可见，HiC技术用于基因组拼接和评价应用火热。
本文将通过还原Rose基因组HiC互作数据来介绍HiC数据标准化与全基因组HiC互作图谱构建的流程。
图1Rose基因组染色体水平拼接与遗传图谱以及HiC全基因组互作图谱关联性（Raymondetal.）
一、流程确认及相关软件介绍
1、流程确认
根据Rose基因组文章在线版本Methods部分的介绍，全基因组HiC互作图谱是通过HiC-Pro来进行HiC数据的标准化并进行互作矩阵的构建，然后通过HiCPlotter进行数据可视化，获得Fig.1的可视化结果。
2、HiC-Pro安装使用极简介绍
HiC-Pro下载